9月21日上午，中共中央政治局常委、国务院总理温家宝在北京市市长郭金龙、副市长丁向阳、吉林，市卫生局长方来英等领导的陪同下视察北京儿童医院，了解有关污染奶粉患儿的就诊情况。总理充分肯定北京市委市政府、市卫生局统一协调，全力救治儿童的做法，并感谢医务人员为此所做的辛勤工作。
   上午九点多，医院就诊病人来了很多，在通往筛查门诊的路上，温家宝总理不时停下来和就诊儿童的家长亲切交谈。在一个外地来的家长对总理说，现在已经给孩子喂进口奶粉，便宜的4—50，贵些的要一百多时，总理关切地询问他们经济上负担能否承受得了？总理对他说：孩子的事情你们着急，政府也着急，我们的心情是一样的。请大家放心，把问题奶停掉，我们一定生产出放心的牛奶。家长含着泪感谢政府、感谢温总理。在拥挤的人群中，一个4—5岁的男孩钻到总理脚下，仰头看着总理，总理弯下身捧着孩子的脸不知说了些什么，孩子笑着对总理说：谢谢爷爷。
    在B超检查室里，听说北京市专门从其他医院抽调医护人员和B超机支援儿童医院，人休机不休，连续运转，总理很高兴，说这项工作做得好，卫生局把全市的医疗力量统一集中在儿童医院，一定能把工作做好。总理关切地询问检查人员一天工作几个小时？能做多少个人？在得知从早上7点开始，一个人一天最多能做100个时，温总理对医护人员们说，你们辛苦了。发生这样的事件，我们要把群众的身体健康安全放在第一位。他希望医护人员要认真、耐心、细致地检查，不漏过一例患儿，对群众负责;检查出患病的孩子，一定要抓紧治疗。接着，他俯下身看着屏幕向检查人员询问孩子的情况，医务人员告诉总理，这个孩子的检查结果是正常的，总理很高兴。看着房间里正在做检查的孩子，总理问陪同的北京儿童医院院长李仲智，检查是不是免费的？李院长告诉总理，对所有要求检查的孩子都是免费的，总理高兴地说：你们辛苦了，谢谢你们做的工作。
    在医院二楼筛查诊室里，总理慢慢坐到一位就诊家长的对面，关切地询问孩子有没有问题？家长告诉总理，检查结果问题不大。医护人员告诉总理，多数家长因孩子吃过有问题的奶粉不放心。温总理说，做父母的不放心，完全可以理解。发生这样的事情，我心里感到很不安，群众着急，医生着急，我们也着急。我们要竭尽全力给孩子们检查，这样大家才能放心。
    总理最后来到肾脏内科病房，这里有6个孩子正在住院治疗。总理在向病房主任询问总体情况后，走到一个孩子的床前。看到孩子正在睡觉，便小声和家长交谈起来。家长告诉总理他们从河北来，孩子从小吃的是有问题的奶粉，现在双肾都有结石，因为当地治疗有困难就来到这里。总理安慰她说：不要着急，北京儿童医院是最好的医院，到这里就放心吧，他们一定能治好孩子的病，家长高兴地点点头。
    在离开病房时，总理和医务人员一一握手，感谢医务人员付出的辛苦。病房主任张桂菊握着总理的手说，为孩子治疗是我们应该做的，感谢总理百忙中来看望大家。她请总理放心，我们一定做好工作，积极为孩子治疗。
    陪同在旁边的李仲智院长告诉总理，来检查的病人中检查出有问题的占到6.5%，而且只有这其中的10%才需要住院治疗。对于一些轻症病人，只需停用问题奶粉，多喝水就可以排出结石。对重症病人通过一些治疗也可以恢复，不需要开刀，总理说：这就放心了。
    在离开医院时，总理再次对医院职工耐心、细致和辛苦的工作表示感谢。对北京市委市政府、市卫生局统一协调的做法给予充分肯定。
    临走时总理还询问了“小儿血液肿瘤中心”建设的进展情况。询问了老院士胡亚美，叮嘱院领导要多关心她的生活。